19.SNP是基因組水平上由單個(gè)核苷酸的變異引起的DNA序列多態(tài)性。科研人員利用SNP對(duì)擬南芥抗鹽突變體的抗鹽基因進(jìn)行定位。
(1)SNP在擬南芥基因組中廣泛存在,在不同DNA分子及同一DNA分子的不同部位存在大量SNP位點(diǎn),某些SNP在個(gè)體間差異穩(wěn)定,可作為DNA上特定位置的遺傳
。
(2)研究者用化學(xué)誘變劑處理野生型擬南芥,處理后的擬南芥自交得到的子代中抗鹽:不抗鹽=1:3,據(jù)此判斷抗鹽為
性狀。
(3)為進(jìn)一步得到除抗鹽基因突變外,其他基因均與野生型相同的抗鹽突變體(記為m),可采用下面的雜交育種方案。
步驟一:抗鹽突變體與野生型雜交;
步驟二:
:
步驟三:
;
步驟四:多次重復(fù)步驟一~步驟三。
(4)為確定抗鹽基因在Ⅱ號(hào)還是Ⅲ號(hào)染色體上,研究者用抗鹽突變體m與另一野生型植株B雜交,用分別位于兩對(duì)染色體上的SNP1和SNP2(見(jiàn)圖)進(jìn)行基因定位。
①將m和B進(jìn)行雜交,得到的F
1植株自交。將F
1植株所結(jié)種子播種于
的選擇培養(yǎng)基上培養(yǎng),得到F
2抗鹽植株。
②分別檢測(cè)F
2抗鹽植株個(gè)體的SNP1和SNP2,若全部個(gè)體的SNP1檢測(cè)結(jié)果為
,SNP2檢測(cè)結(jié)果SNP2
m和SNP2
B的比例約為
,則抗鹽基因在Ⅱ號(hào)染色體上,且與SNP1
m不發(fā)生交叉互換。
(5)研究者通過(guò)上述方法確定抗鹽基因在某染色體上,為進(jìn)一步精確定位基因位置,選擇該染色體上8個(gè)不同的SNP,得到與抗鹽基因發(fā)生交叉互換的概率,如表。據(jù)表判斷,抗鹽基因位于
SNP位置附近,作出判斷所依據(jù)的原理是
。
SNP的位置 |
-18 |
-14 |
-6 |
1 |
4 |
11 |
16 |
22 |
發(fā)生交叉互換的概率(%) |
22.22 |
11 |
1.39 |
4.17 |
4.17 |
5.56 |
8.33 |
5.56 |
(6)結(jié)合本研究,請(qǐng)例舉SNP在醫(yī)學(xué)領(lǐng)域可能的應(yīng)用前景
。