閱讀下列材料回答問(wèn)題：
材料一：世祖皇帝建元中統(tǒng)以來(lái)，始末取故老諸儒之言，考求前代之前典，立朝廷而建官府，輔相者曰：“中書(shū)省”；本兵者曰：“樞密院”主彈劾者曰：“御史臺(tái)”…夫外之郡縣，其朝廷遠(yuǎn)者。則鎮(zhèn)之以行中書(shū)省…苦邊徼之事者，則置宣尉可以達(dá)之…舉刺之事，則有行御史臺(tái)領(lǐng)監(jiān)察御史、肅政廉訪司之。
---引自《元文類(lèi)》卷四十材料二：據(jù)史書(shū)記載，元朝統(tǒng)一全國(guó)后的疆域“北逾陰山，西及流沙，東盡遼左，南越海表”即北到西伯利亞，南到南海，西南包括今西藏、云南，西北至今新疆，東北到鄂霍次克海。其疆域之廣，居中國(guó)各朝之冠。與漢、唐極盛時(shí)期的疆域相比，元朝不僅在面積上大大超過(guò)了它們，而且在控制程度上也遠(yuǎn)勝于它們。
（1）材料一中掌管全國(guó)行政事務(wù)的是哪一機(jī)構(gòu)？在歷史上產(chǎn)生深遠(yuǎn)影響的是哪一制度？
（2）閱讀材料二元朝為了對(duì)遼闊的疆域進(jìn)行有效的治理，設(shè)立了什么行政機(jī)構(gòu)來(lái)管轄臺(tái)灣？在西藏地區(qū)設(shè)立的宣慰使司都元帥府，由哪一機(jī)構(gòu)直接統(tǒng)轄？
（3）通過(guò)上述材料，你對(duì)于國(guó)家領(lǐng)土主權(quán)有什么認(rèn)識(shí)？